技術文章
TECHNICAL ARTICLES原代細胞核接頭蛋白LDB1是多蛋白轉錄復合體中的一個核心成分。Li等研究發現, 在小鼠胚胎和成體造血干細胞中LDB1起到關鍵作用。在造血干細胞和前體細胞中敲除該基因會造成一些維持多能性相關基因的轉錄下調, ChIP-Seq結果顯示, LDB1形成的復合體結合在這些基因的啟動子區域, 暗示 LDB1維持造血干細胞中起核心作用。
多能造血前體細胞是一種干細胞樣細胞, 表達各種基因, 且有分化成包括免疫系統細胞在內的大量不同類型血細胞的能力。Zhang等利用ChIPSeq和RNA-seq技術在小鼠全基因組內找出造血前體細胞轉化成定型T細胞中起作用的所有基因, 并確定了每個基因在發育過程中的轉錄時間點。同時, 還追蹤了指引前體細胞到各種替代途徑中的基因。結果不僅揭示了T細胞發育過程的時空調控網絡, 也表明了T細胞發育過程如何關閉啟動替代命運的基因。
少突膠質細胞(oligodendrocyte, OL)是中樞神經系統的髓鞘形成細胞, 原代細胞來源于其前體細胞。Olig2 是一種少突膠質細胞轉錄因子, 與前體細胞增殖和向少突膠質細胞分化密切相關。Yu等利用ChIPSeq進行全基因組分階段研究發現Olig2充當了一種預定位(prepatterning)因子, 引導染色質重塑酶 Smarca4/Brg1到達少突膠質細胞活性靶點, 從而通過Brg1激活少突膠質細胞特定基因表達。Olig2和Brg1在染色質上的結合還指導重要的表觀遺傳修飾信息, 并預測重要的少突膠質細胞分化調控基因。
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原代細胞
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